技术简介

      全基因组DNA 甲基化测序（WGBS，Whole Genome Bisulfite Sequencing）是一种单碱基分辨率鉴定全基因组范围内DNA 甲基化水平的技术，是研究DNA 甲基化的黄金标准。该技术的主要原理是通过对DNA 样本进行亚硫酸盐处理，未甲基化的胞嘧啶（C）被亚硫酸盐转化为尿嘧啶（U），而甲基化的胞嘧啶则不受影响。转化后的DNA 随后进行文库构建和高通量测序，通过比较处理后的DNA 序列与参考基因组序列的差异，可以准确地定位和量化DNA 甲基化位点。WGBS 技术允许研究者深入理解甲基化在基因表达调控、生长发育以及疾病形成中的作用，是表观遗传学研究的高效工具。WGBS 能为基因组DNA 甲基化时空特异性修饰的研究提供重要技术支持，能广泛应用在个体发育、衰老和疾病等生命过程的机制研究中，也是各物种甲基化图谱研究的首选方法。

技术流程

1. 高质量基因组DNA 提取；

2. 亚硫酸盐处理基因组DNA；

3. 文库构建；

4. 测序；

5. 数据的生物信息分析，鉴定全基因组5mC位点。

技术应用

1. 绘制全基因组单碱基分辨率甲基化图谱^[1]；

2. 研究胚胎发育、衰老等生理活动的表观遗传机制^[2]；

3. 研究疾病相关甲基化分子标志物^[3]。

技术优势

1. 精准鉴定CpG 富集位点，达到单碱基分辨率；

2. 覆盖全基因组，获得的甲基化信息更完整，是DNA甲基化研究的金标准。

参考文献：

[1]Feng L, Lou J. DNA Methylation Analysis. Methods Mol Biol. 2019;1894:181-227. doi: 10.1007/978-1-4939-8916-4_12. PMID: 30547463.

[2]Liu Y, Zhang Y, Yin J, Gao Y, Li Y, Bai D, He W, Li X, Zhang P L,i R, Zhang L, Jia Y, Zhang Y, Lin J, Zheng Y, Wang H, Gao SZ, eng W, Liu W. Distinct H3K9me3 and DNA methylation modifications during mouse spermatogenesis. J Biol Chem. 2019 Dec 6;294(49):18714-18725. doi: 10.1074/jbc.RA119.010496. Epub 2019 Oct 29. PMID: 31662436; PMCID: PMC6901318.

[3]Jima DD, Skaar DA, Planchart A, Motsinger-Reif A, Cevik SE, Park SS, Cowley M, Wright F, House J, Liu A, Jirtle RL, Hoyo C. Genomic map of candidate human imprint control regions: the imprintome. Epigenetics. 2022 Dec;17(13):1920-1943. doi: 10.1080/15592294.2022.2091815. Epub 2022 Jul 4. PMID: 35786392; PMCID: PMC9665137.

技术服务

睿锶生物具有多年的DNA 甲基化实验和数据分析经验，产生了多种动植物的高质量的WGBS 实验数据。