
“ChIP-Seq 染色质免疫共沉淀测序,将染色质免疫沉淀技术(ChIP)与新一代测序技术(NGS)相结合,能高效地在全基因组范围内检测与组蛋白修饰、转录因子等互作的DNA区段,是研究基因调控和表观遗传学的重要技术。自2007年问世以来,ChIP-Seq一直需要通过一系列冗长的手动步骤进行,限制了该技术的通量和灵敏度,随着自动化、智能算法等新技术在生命科学领域的普及应用,表观组学领域也将迎来新一轮的工具革新。”
为什么要将ChIP-Seq自动化?
迄今为止,大多数ChIP-Seq都是依赖于人手工操作的,在实际应用中存在多个挑战:
01 技术门槛高
实验的打断条件、重复性差等都需要系统的摸索才能得到较好的结果,这些因素导致 ChIP 对新手非常不友好。一个初进入实验室的研究生或实验员做ChIP-Seq实验,要经过长时间的预实验训练,再配合超声仪等精密设备才能得到满意的结果。
02 实验流程复杂,耗时耗力
整个过程涉及大量手工实验,如交联、超声破碎、免疫沉淀、建库测序等多个步骤,操作时间长,从样本处理到构建文库,通常需要 3–5天才能完成。
03 实验重复性差
实验操作条件和质量控制对结果影响较大,不同的实验人员产生的数据具有一定差异性,例如染色质片段化(超声)和抗体富集步骤对实验条件敏感,优化难度大,也容易导致数据重复性差。
04 对细胞数量要求高
ChIP-Seq通常需要大量的细胞,一般在10⁵-10⁷个细胞,这限制了其在细胞数量有限的样本,如单细胞、稀有细胞类型或珍贵样本中的应用。
05 数据分析复杂
ChIP-Seq产生的数据量巨大,需要专业的生物信息学知识和技能来进行数据分析和解读,包括序列比对、峰值识别、功能注释等,对数据分析人员的要求较高。
为了解决这些传统表观基因组技术的应用难点,睿锶生物(RUISBIO)通过多年实验技术优化,成功改良了ChIP-Seq技术,使它更适合自动化仪器的操作,并在自动化CUTag仪的基础上拓展升级实验模块,诞生了自动化ChIP-Seq仪。标准化、高通量的自动化ChIP-Seq仪,搭配睿锶生信分析软件,应用于组蛋白修饰和转录因子全基因组结合位点鉴定等方面,能最大限度地减少人工干预并提升通量,是提高大规模表观基因组研究分析效率、降低人为错误、确保研究可重现性的关键利器。

效率革命!自动化ChIP-Seq仪
表观组学研究新利器
自动化ChIP-Seq仪 AutoChIP4 ,用于染色质免疫沉淀测序(ChIP-Seq)实验流程的全自动化操作。该系统采用一体化设计,高度集成了样本处理、染色质提取、免疫沉淀、测序文库构建等功能,实现从细胞裂解、染色质剪切、抗体富集到文库构建的全流程自动化,无需人工多步干预,极大地简化实验流程。
门槛消除,新手也能一键启动
一个没有经过训练的新手做ChIP-Seq实验,只需基础了解实验知识背景和仪器使用注意事项,即可立即上手操作。

效率革命,时间压缩3倍以上
实现“样本进-文库出”,人工操作时间不到半小时,放入仪器后等待一天即可拿到文库。相比于传统的ChIP-Seq需要至少三天的时间完成,自动化ChIP-Seq仪仅需要25小时即可完成一次ChIP-Seq实验,实验时间压缩3倍以上。

1代N+,占地面积不到1平
人工需要用到的超声仪,PCR仪,恒温金属浴、离心机等设备,以及满桌的试剂耗材移液枪,现在只需要一台占地不到1平米的工作站就能替代。

通量跃升,大规模表观研究快人一步
设备支持高通量样本的自动化并行处理,无需交联和超声打断,适用大规模表观遗传调控元件的系统性研究和多条件、多样本批量分析。拥有从4样本通量到96样品通量的拓展,效率更进一步,可广泛应用于高通量表观遗传学研究、组蛋白修饰分析、转录因子结合位点鉴定等领域。

专业配套试剂耗材
睿锶提供配套的ChIP-Seq试剂盒,运用先进的分子生物学技术和高特异性抗体,能够精准捕获目标蛋白结合的 DNA 片段,适用于多种样本类型,包括动物细胞、植物细胞、组织样本等。无论是探索转录因子的结合位点,还是研究组蛋白修饰与基因表达调控的关系,该试剂盒都能满足不同的科研需求。

自动化 VS 手工
ChIP-Seq 数据高质量稳定产出
自动化ChIP,无人工干预,在高效免疫沉淀等环节有效避免了消除交叉污染。而在工程层面,睿锶通过不断优化调试机械臂进行稳定的液体处理操作,在整个实验过程中可以最大程度地减少样本损失,赋予了AutoChIP4低输入样本、高灵敏度的特性,最终做到从极少量的样本中即可获得高质量的分析结果。
以下是自动化ChIP-Seq仪与人工操作ChIP-Seq实验结果:

AutoChIP:自动化仪器产生数据
HandChIP:人工操作实验数据
将两者产生的数据的对比(左图),可以看到,自动化仪器数据与手工数据基本一致。
右图的相关性比较,可以看到自动化仪器具有很高的相关性,数值接近1。这进一步证明了自动化ChIP-Seq仪产生数据的高质量和稳定性。而实验重复性和数据一致性的显著提升,将帮助科研工作降低运作成本。
染色质免疫沉淀测序
一台设备轻松搞定!
自动化ChIP-Seq仪 AutoChIP4
让表观基因组学科研快人一步
自动化ChIP-Seq仪的出现为高通量、低成本的实现大规模表观基因组研究提供了高效可靠的解决方案,它降低了获取表观基因组数据的门槛和成本,期待未来ChIP实验完成自动化升级,科研工作者能够利用先进工具带来的规模效应,快速、可重复的捕获几十甚至上百个蛋白质-DNA接触图谱,加速生命奥秘的解码探索。
关于 "睿锶生物RUISBIO
睿锶生物(RUISBIO)是一家聚焦表观三维基因组学技术创新的高科技企业,自2021年创立以来,公司立足武汉,建有1200㎡现代化研发中心与生产基地,组建了占比超80%的核心研发团队,构建了"设备+技术+算法"三位一体的技术体系,为生命科学基础研究和产业化应用提供全链条解决方案。
公司聚焦自动化表观三维基因组分析仪器开发和推广,目前研发出系列自动化设备,包括自动化CUTag仪、ChIP-Seq仪,实现从样本自动化前处理、文库构建自动化到一键式数据分析的全流程闭环。基于多种深度学习模型等AI算法,公司开发了表观基因组特征和染色质结构预测算法,支撑表观三维基因组数据在医学与生物育种领域的应用。
咨询电话 400-689-7068
官方网站 www.ruisbio.com
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