转录组是指特定组织或细胞在某个时间或某个状态下转录出来的所有RNA的总和,主要包括mRNA和非编码RNA。转录组研究是研究基因功能和结构的基础,对生物体的发育和疾病的发生具有重要作用。
RNA-seq 即转录组测序技术,就是使用高通量测序技术检测出mRNA和某些non-coding RNA的核苷酸序列,并结合生物信息分析反映出它们的表达水平。随着测序相关技术的发展以及测序成本的降低,RNA-seq 凭借高通量、高灵敏度、应用范围广等优势,已成为转录组研究的主要方法。
有参转录组测序是对有参考序列的物种利用双端测序技术进行测序,通过与参考序列进行比对,统计基因的表达量,并进行差异分析和功能富集分析。该技术流程主要包含两个部分,建库测序和数据分析。
图1 测序碱基含量分布图 图2 测序质量分布图
图3 测序数据GC含量分布图 图4 基因火山图
图5 差异基因热图 图6 双疾病差异基因GO富集分析
图7 差异基因KEGG图
© All Rights Reserved. 地址:武汉市江夏区郑店街光谷南(郑店)大健康产业园东湖高新国际健康城 B 地块1号楼 7 层
电话:400 689 7068 手机:18171276512 Email:sales@ruisbio.com